肛交作为夫妻性生活方式的一种，但是这种方式其实存在很大的危害：
一是肛门内的卫生情况比阴道内要差，正常女性的阴道是酸性的，有杀菌功能，而肛门内含有大量细菌，有一些细菌可致病，所以肛交是不够卫生的；
二是肛门分泌液较少，不像在性兴奋时阴道口及阴道内分泌的大量润滑作用的液体，所以说肛交时男性快感较差；
三是肛交毕竟是非正常的性交，长期采取这种方式,会导致正常的性交感觉变差；
四是肛门比阴道要紧，易导致女性肛门的损伤、血肿、甚至痔疮等，对夫妻双方身体都不利，所以我们不提倡肛交。对于有些提到的艾滋病说法，我们认为，从现代医学的观点来看，感染艾滋病一定要有艾滋病毒的存在为前提，而且关于这种病毒的起源还没有结论，医学界正处于研究阶段，所以你们不必过于担心。
五 肛交或肛门性交 是指涉及肛门和直肠的一种 人类性行为 。它通常是指勃起的 阴茎 插入肛门的行为，但是使用性具或其它涉及肛门和直肠的行为也可以认为是肛交。在男同性性行为中，肛交可以在承受方中获得 前列腺快感 ，这种快感的成因尚未有权威的解释。其大致过程是，前列腺受到节奏性的适度刺激后，可以引起骨盆周围以及阴部的交感神经极度兴奋，从而带来生理快感，这种快感因人而异，部分人群可能终生无法体验前列腺快感。
肛交是性交的一种方式，由于肠道细菌较多容易诱发感染，并且性交过程中容易出现肛裂等肛肠疾病。从健康的角度来讲建议控制肛交。
肛交的性行为，可能会导致肛管或肛周的疾病，比如说尖锐湿疣的问题，尤其是肛管内的，没有及时发现的话，容易给治疗造成一些麻烦，它可能会变得比较大，面积会比较宽，而且治疗起来比较困难，很容易复发，这些情况从长远来说，再加上大便从那通过的话，有时容易导致一些感染，像这种情况可能会导致一些其他的合并症。比如说导致肠道的功能紊乱，甚至会引起癌变的可能，这是进一步的危害了。